绿水是水中绿藻过度繁殖引起的，不是阳光直射一个原因，没有阳光直射也能引起绿水的发生。绿水常发生在建缸初期，由于硝化系统还没建立起来，在光照、温度、有机物、无机物的共同作用下，水中绿藻大量繁殖，引发绿水。
老缸发生绿水有一个原因是清洗过滤材料时，把过滤材料全部清洗，使硝化菌无法存在，引起硝化系统的崩溃。
绿水初期，水呈浅绿色，过一段时期后呈深绿色，这时如不处理，将会发展成暗绿色，鱼就有危险。原因是这时大量的绿藻与鱼共同夺氧后使鱼缺氧。再不处理，就会在某天清晨，你会看到缸水特别清，缸底全是死鱼和一层绿藻。这就是俗称的死水。原因是绿藻是低等植物，与其他植物一样，夜里吸氧。这时缸中水的氧气为零。
绿水发生后怎样处理呢？
有的鱼友不断的换水，但换水后崭时水清些，几天后水还变绿。有的人甚至翻缸处理，但过段时间水还会绿。原因是绿藻的繁殖速度是惊人的，它们以几何的倍数滋长。
有的鱼友在缸中放清苔鼠、清扫夫等工作鱼，但绿藻和绿苔是两个概念，工作鱼对绿藻引发的绿水无效。
有的鱼友在绿水里加清藻剂、净水剂等化学药品，但你如果买的是伪劣或过期的，会适得其反。另外化学药品制标不制本， 所以要慎用。
用紫外线杀菌灯灭藻效果不错，但价格较贵，使用不当对鱼有伤害。要慎用。
最根本的解决办法，就是在缸中建立强大的硝化系统，仰制和消灭绿水的形成。硝化系统建成的时间，一般15-30天，在没有建成前发生绿水，要少喂食、勤换水、减少光照或不开灯同时进行。过十几天后，绿水会逐渐变清，缸水特别透亮。
生化过滤要注意以下几点：
1生化材料要占水体总量的2%以上，以形成强大的硝化系统。
2硝化菌是喜氧菌，所以循环水泵24小时常开不停。
3水泵流量每小时循环缸水3-5倍以上。
4生化材料要避光。
5成品缸上滤盒容量小，可以做生化桶或反气举，弥补上过滤的不足。